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A bióloga Lynn Margulis publicou um polêmico artigo em 1967 propondo que algumas organelas das células eucarióticas poderiam ser o resultado de eventos de endossimbiose, no qual bactérias passaram a viver em simbiose dentro de células eucarióticas até serem completamente incorporadas a elas. A hipótese de Margulis sofreu muita oposição, até que evidências experimentais mostraram que algumas organelas de fato possuíam muitas similaridades com bactérias. Entre as evidências de endossimbiose, podemos citar:
As membranas duplas dos núcleos.
Os ribossomos aderidos ao retículo endoplasmático.
A parede celular das células vegetais.
O formato do complexo de Golgi.
O genoma circular das mitocôndrias.
O genoma circular das mitocôndrias é uma evidência do seu parentesco com organismos procariontes. No processo de endossimbiose, bactérias teriam se adaptado à vida dentro da célula eucariótica e originado as mitocôndrias e os cloroplastos.
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